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18/03/2019 - 21/03/2019

FROGS formation : tools for bioinformatics and statistics analyses with amplicon metagenomics data

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul - NED - TWB - Signeae

12/02/2019

Formation : RNAseq de novo assembly

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul - Sigenae et MIA-Toulouse

02/07/2019 - 05/07/2019

JOBIM 2019

Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques proposées par SFBI,  IFB et GDR BIM, Nantes

Assistant ingénieur en statistique

Période d'emploi: 
01/03/2019 - 31/12/2019
12/12/2018

Istex Tour 2018 - Paris Saclay

Intervention de Claire Nedellec (Inra, MaIAGE) "OpenMinTed & Visa TM : infrastructure de Text Mining en partenariat avec ISTEX"

Some reasons why the latent period should not always be considered constant over the course of a plant disease epidemic

An untargeted metabolomics approach to investigate the metabolic modulations of HepG2 cells exposed to low doses of bisphenol A and 17 beta-estradiol

06/12/2018

19e Journée du Réseau AIGM

Journée du réseau méthodologique MIA Algorithmic Issues for Inference in Graphical Models, MIA-Toulouse

Steady state analysis of a syntrophic model: The effect of a new input substrate concentration

Thèse CIFRE : Analyse d'images en élevage aviaire

Période d'emploi: 
01/01/2019 - 31/12/2021

Stage en développement informatique

Période d'emploi: 
01/03/2019 - 31/08/2019

Investigating the methylome of grape and oak under water stress

Période d'emploi: 
01/01/2019 - 31/12/2019

Modelling intercrops with the STICS soil-crop model

Période d'emploi: 
01/12/2018 - 31/05/2020
19/11/2018

Séminaire du Réseau Payote

Organisé par le réseau méthodologique Inra Payote

13/12/2018

Rencontres régionales BioInfo/BioStat du Génotoul

Organisées par les Plateformes BioInformatique et BioStatistique du Génotoul et soutenues par MIA-Toulouse

18/03/2018 - 22/03/2019

Ecole chercheurs BioBayes 2019

Organisée par la Formation Permanente de l'Inra avec le Collectif BioBayes

Addressing global ruminant agricultural challenges through understanding the rumen microbiome: Past, present, and future

31/12/2018

Migazette n°17 (septembre 2018)

La Migazette n°17 (septembre 2018) en parue.

03/10/2018 - 05/10/2018

Stodep2018 : Statistical topics and stochastic models for dependent data

Intervention de Rachid Senoussi (Inra, BioSP) "On several relations between autoregressive processes in continuous time and discrete time"

31/01/2019 - 01/02/2019

Workshop on Statistical Methods for Post Genomic Data (SMPGD) 2019

Sylvie HUET (INRA, MaIAGE), Mahendra MARIADASSOU (INRA, MaIAGE), Stéphane ROBIN (MIA Paris), Bertrand SERVIN (INRA, GenPhySE) dans le comité scientifique.

Assessing the aerial interconnectivity of distant reservoirs of Sclerotinia sclerotiorum

20/09/2018

Journée de découverte du langage Go

Organisée par les PEPIs IDL et IBIS et financée par l'unité Ingenum

27/09/2018

Journée thématique - Intégration et la Visualisation de données

Organisée par le PEPI IBIS et financée par l'unité Ingenum

Ridge regression for the functional concurrent model

Post-Doc miRNA analyses in mouse and human samples

Période d'emploi: 
03/09/2018 - 31/08/2020
12/11/2018 - 13/11/2018

Rencontres du Réseau Mexico 2018

Rencontres annuelles du Réseau méthodologique MIA Mexico

Advances in computational modeling approaches in pituitary gonadotropin signaling

26/11/2018 - 29/11/2018

Metagenomic amplicon & stat with FROGS

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul -MIA- Toulouse

A new proof of the competitive exclusion principle in the chemostat

10/07/2018 - 12/07/2018

DATAIA-JST International Symposium on Data Science and AI - Paris

Présentations de Claire Nedellec (Inra, MaiAGE) "Ontology-based text mining for microbiology research" et Hervé Monod (Inra, Dept MIA) "DigitAg - tbc"

29/06/2018

Migazette n°16 (juin 2018)

La Migazette n°16 (juillet 2018) en parue.

Modeling and analysis of random and stochastic input flows in the chemostat model

Heterosis Is a Systemic Property Emerging From Non-linear Genotype-Phenotype Relationships: Evidence From in Vitro Genetics and Computer Simulations

14/11/2018

Formation RNAseq alignment and transcripts assemblies

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul - MIA-Toulouse

13/11/2018

Formation Cluster

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul - MIA-Toulouse

12/11/2018

Formation Linux

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul - MIA-Toulouse

PhD in epidemiological modeling

Période d'emploi: 
01/10/2018 - 30/09/2021

Optimal strategies to refill hydric reservoirs with reused water – application to the Jaunay Lake case study

Ingénieur bio-informaticien assemblage et annotation de génomes de poissons

Période d'emploi: 
01/09/2018 - 31/08/2019

Progress and prospects in gender visibility at SMBE annual meetings

Effect of control parameters on biogas production during the anaerobic digestion of protein-rich substrates

Modelling an artificial microalgae-cyanobacteria ecosystem

A “Fork-to-Farm” multi-scale approach to promote sustainable food systems for nutrition and health: A perspective for the mediterranean region

Adaptive estimation of high-dimensional signal-to-noise ratios

Detecting Markov random fields hidden in white noise

Relations between socio-economic factors and nutritional diet in Vietnam from 2004 to 2014: new insights using compositional data analysis

22/10/2018 - 26/10/2018

Research School : Masterclass in Bayesian Statistics

Parmi les intervenants : Marie-Pierre Etienne, MIA-Paris (Equipe MORSE)

12/10/2018

Formation : Graphiques avancés avec R

Module d'apprentissage - unité MIA-Toulouse, PF BioStatistique du Génotoul

27/09/2018 - 28/09/2018

Formation: Initiation à la statistique avec R

Module d'apprentissage - PF  BioStatistique du Génotoul et unité INRA MIA-Toulouse

Major changes in the composition of a Southern Ocean bacterial community in response to diatom-derived dissolved organic matter

Properties of the chemostat model with aggregated biomass

On the derivation of a simple dynamic model of anaerobic digestion including the evolution of hydrogen

Incentives under Upstream-Downstream Moral Hazard Contract

How to manage a small-scale multi-use forest ?

21/06/2018 - 22/06/2018

Workshop Mixture models: theory and applications

Colloque sur les modèles de mélange et leurs applications en particulier en biologie et médecine. M.-L. Martin-Magniette (MIA-Paris/IPS2), Andrea Rau (GABI) et Sandrine Laguerre (LISBP) dans le comité d'organisation

25/06/2018 - 28/06/2018

Formation: Metagenomic amplicon & stat

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul -MIA- Toulouse

14/06/2018 - 15/06/2018

Workshop METMA 2018

Short course: An introduction to geostatistical analysis of spatio-temporal data with R, Denis Allard, BioSP, INRA ; Liliane Bel, AgroParisTech ; Edith Gabriel, Université d'Avignon ; Thomas Opitz, BioSP, INRA ; Eric Parent, AgroParisTech

31/05/2018 - 01/06/2018

9e JFRB 2018

9èmes Journées Francophones sur les Réseaux Bayésiens et les Modèles Graphiques Probabilistes organisées par l'unité MIA-Toulouse

15/02/2018

Migazette n°15 (Fév.2018)

Numéro 15 de la gazette de la Plateforme Migale (unité MaIAGE)

12/03/2018 - 16/03/2018

Formation doctorale: Introduction à la modélisation structure-fonction des plantes

À destination des doctorants en biologie végétale ou en mathématiques appliquées à la biologie (en particulier les doctorants inscrits dans les ED GAIA et I2S)

A framework for modeling adaptive forest management and decision making under climate change

05/06/2018

Formation: RNAseq de novo assembly

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul -MIA- Toulouse

08/10/2018 - 10/10/2018

Formation: Reads alignment and small size variants calling with Galaxy

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul -MIA- Toulouse

09/04/2018 - 12/04/2018

Formation: Metagenomic amplicon & stat

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul -MIA- Toulouse

26/03/2018 - 27/03/2018

Formation: Initiation à la statistique avec R

Module d'apprentissage - PF  BioStatistique du Génotoul et unité INRA MIA-Toulouse

11/06/2018 - 12/06/2018

Formation: Initiation à la programmation à R

Module d'apprentissage - PF BioStatistique du Génotoul et unité INRA MIA-Toulouse

26/03/2018 - 30/03/2018

Ecole-chercheurs : Analyse de sensibilité, métamodélisation et optimisation de modèles complexes

Organisé à La Rochelle par le réseau méthodologique MIA Mexico et la Formation Permanente INRA.

08/02/2018

Journée scientifique: Statistical Advances for Real Data Problems

Parmi les orateurs : Agathe Guilloux (LaMME, Univ. d'Evry), Estelle Kuhn (MaIAGE), Céline Lévy-Leduc, (MIA-Paris, AgroParisTech)

A bioenergetics model of the entire life cycle of the three-spined stickleback, gasterosteus aculeatus

12/03/2018 - 29/06/2018

Cycle de formations "BioInformatique par la Pratique"

Cycle de formation organisé par la Plateforme Migale (unité MaIAGE, Jouy-en-Josas) 

Estimating virus effective population size and selection without neutral markers

High biomass density promotes density-dependent microbial growth rate

Assessment of evaporative cooling efficiency in greenhouses equiped with wetted porous plates

The bacterial interlocked process ONtology (BiPON): a systemic multi-scale unified representation of biological processes in prokaryotes

01/11/2017 - 01/03/2018

Migazette n°14 (nov. 2017)

N°14 de la gazette  de la Plateforme Migale (Unité Inra MaIAGE - Jouy-en-Josas)

14/12/2017

Journée du Club de Rencontre AppliBUGS

Journée Applications du Bayesian Unified Group of Statisticians, AgroParisTech (Paris)

The virtual food system: Innovative models and experiential feedback in technologies for winemaking, the cereals chain, food packaging and eco-designed starter production

13/11/2017 - 15/11/2017

Workshop "Recent advances in cell & cell community modeling"

Organisé par l'unité MaIAGE (Jouy-en-Josas)

About the minimal time crisis problem

Modelling CO 2 transfer in foil ripened semi-hard Swiss-type cheese

17/01/2018 - 18/01/2018

Workshop: Bioinfo/Biostat

Journées 2018 des Plateformes Biostat et BioInfo du Genotoul, Institut de Mathématiques de Toulouse - Université Paul Sabatier

26/11/2017 - 01/12/2017

AlgoSB - Winter School 2017

One day Course "Advanced combinatorial optimization methods for protein design", T. Schiex (unité MIA-Toulouse), Cargèse.

30/11/2017

Demi-journée "autour de la bioinformatique à Jouy-en-Josas"

Organisée par la Plateforme Migale (unité MaIAGE)

14/12/2017

18ième Journée du Réseau AIGM

Journée du réseau méthodologique MIA Algorithmic Issues for Inference in Graphical Models, MIA-Toulouse

01/02/2018 - 02/02/2018

Formation : Reads alignment and small size variants calling with Galaxy

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul -MIA- Toulouse

29/01/2018 - 31/01/2018

Formation : Galaxy initiation, RNAseq, SARTools

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul -MIA- Toulouse

06/02/2018

Formation : RNAseq de novo assembly

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul -MIA- Toulouse

28/05/2018 - 01/06/2018

50èmes Journées de Statistique SFDS 2018

Estelle Kuhn, Sophie Schbath et Mahendra Mariadassou (Unité INRA MaiAGE) dans le comité d'organisation, Paris-Saclay

09/10/2017 - 10/10/2017

Workshop RCAM 2017 -

Recent Computational Advances in Metagenomics organisé par MaIAGE, GdR BiM, et Institut Pasteur

03/07/2018 - 06/07/2018

JOBIM 2018

Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques proposées par SFBI,  IFB et GDR BIM, Palais du Pharo - Marseille

Inferring incomplete lineage sorting, duplications, transfers and losses with reconciliations

Inherent relevance of MRMT models to concentration variance and mixing-induced reactivity

18/10/2017 - 20/10/2017

BioSynSys 2017

 3e Conférence du GDR de Biologie de Synthèse, La Grande Motte

16/11/2017 - 17/11/2017

Rencontres du Réseau Mexico 2017

Journées du réseau méthodologique MIA, Montpellier

09/07/2019 - 12/07/2019

Conférence UseR! 2019

Conférence internationale autour du logiciel R coorganisée par les départements Inra MIA, SAE2 et SA, Toulouse

18/09/2017 - 15/02/2018

Thematic Semester on Mathematic and Computer Science in Biology

Exposés : Apprentissage de la structure d'un réseau bayésien dynamique étiqueté ..., E. Auclair, N. Peyrard, R. Sabbadin (MIA-Toulouse)  - Estimation de l'histoire évolutive d'une espèce ..., S. Boitard, B. Servin (GenPhySE)

Atelier :  Introduction à l'analyse de réseaux, N.Villa-Vialaneix (MIA-Toulouse)

27/10/2017

Formation "Graphiques avancés avec R"

Module d'apprentissage - unité MIA-Toulouse, PF BioStatistique du Génotoul 

26/10/2017 - 27/10/2017

Journées STraTEGe

Journées du réseau méthodologique MIA (Paris)

04/10/2017 - 05/10/2017

Colloque PAYOTE 2017

Colloque organisé par le réseau méthodologique Inra PAYOTE (Paris)

17/10/2017 - 19/10/2017

XIe séminaire des utilisateurs de Stics

Organisé par le réseau scientifique EA Stics (La Rochelle)

Optimal control of physical backwash strategy - towards the enhancement of membrane filtration process performance

Limit theorems for some branching measure-valued processes

06/11/2017 - 09/11/2017

Training Metagenomic Amplicon Analysis & Stat - FROGS

Module d'apprentissage - PF BioInformatique du Génotoul - MIA-Toulouse

22/11/2017 - 24/11/2017

Workshop MixOmics - Autumn School 2017

Organisé par la PF BioStatistique du Genotoul et l'unité MIA-Toulouse

30/04/2018 - 05/05/2018

JDF2018: Workshop RED "journées DEVS francophones"

Workshop organisé par le réseau méthodologique MIA RED (Cargèse)

02/10/2017 - 06/10/2017

Formation à l'utilisation de RECORD

Organisé par le réseau des utilisateurs Record (Toulouse)

11/01/2018 - 12/01/2018

Workshop SMPGD 2018 : Statistical Methods for Post Genomic Data

Workshop annuel co-organisé par S.Huet (MaIAGE) et S.Robin (MIA-Paris) 

Asymptotic stability of a coupled advection-diffusion-reaction system arising in bioreactor processes

Thermodynamic characterization of single-stage spray dryers: Mass and energy balances for milk drying

Estimating the intensity function of spatial point processes outside the observation window

Review: To be or not to be an identifiable model. Is this a relevant question in animal science modelling?

Time-optimal control of concentrations changes in the chemostat with one single speciestn1]

The generalized Simpson's entropy is a measure of biodiversity

Socioeconomic and environmental determinants of dengue transmission in an urban setting: An ecological study in Noumea, New Caledonia

Erratum: The combination of the functionalities of feedback circuits is determinant for the attractors' number and size in pathway-like Boolean networks (vol 7, 42023, 2017)

The combination of the functionalities of feedback circuits is determinant for the attractors' number and size in pathway-like Boolean networks

A mathematical model for tailoring antimicrobial packaging material containing encapsulated volatile compounds

Equivalence of Finite Dimensional Input-Output Models of Solute Transport and Diffusion in Geosciences

Oracle inequalities for network models and sparse graphon estimation

Modelling the probability of microhabitat formation on trees using cross-sectional data

12/11/2017 - 17/11/2017

6ème ECOLE DE BIOINFORMATIQUE Aviesan-IFB

"Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit", Roscoff

co-coordinateurs scientifiques : C. Caron (IngeNum), M. Zytnicki (MIA-Toulouse)

A transcriptome multi-tissue analysis identifies biological pathways and genes associated with variations in feed efficiency of growing pigs

De novo annotation of transposable elements : tackling the fat genome issue

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