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Transcriptome et méthylome du duodénum avant et après un repas chez deux lignées de porcs divergeant sur un critère d'efficacité alimentaire

Description: 

Stage Master 2 - 6 mois

L’alimentation représente un des principaux postes budgétaires en élevage porcin. L'efficacité alimentaire des animaux est donc un critère de sélection pertinent pour la filière. Des animaux mangeant moins pour produire une même quantité de viande permettent aussi de réduire l’impact environnemental de l'élevage. L’INRA développe depuis une vingtaine d’années des lignée divergentes de porcs de race Large White sur un critère d'efficacité alimentaire, sélectionnant deux lignées produisant plus ou moins de viande pour une même quantité de nourriture ingérée.

Pour mieux caractériser les différences entre lignées efficace et peu efficace, nous comparerons le transcriptome et le méthylome du duodénum de porcs issus de ces deux lignées, à jeun ou après un repas. Nous pourrons ainsi identifier les gènes différentiellement exprimés dans le duodénum avant et après un repas, et comparer la réponse des deux lignées divergentes. Nous étudierons aussi dans quelle mesure les méthylomes (cartographie pangénomique de la méthylation de l’ADN) des deux lignées permettent d’expliquer ces différences de transcriptomes (n = 24).

 

 Objectifs du stage :

  • identifier les gènes différentiellement exprimés dans le duodénum de porcs avant et après un repas
  • identifier les gènes différentiellement exprimés et les régions différentiellement méthylées dans le duodénum entre lignées de porcs à faible et forte efficacité alimentaire
  • Corréler différences de méthylation et différences d’expressions entre les lignées.
Type de l'offre: 
Date limite de la candidature: 
31/12/2019
Période d'emploi: 
01/01/2020 - 30/06/2020
Email du contact: 
Unité de recherche d'affectation: 
Localisation CR INRA: