Le microbiotehumain joue un rôle majeur dans les infections de l'hôte. Il peut avoir un impact sur la sensibilité de l'hôte, l'issue de l'infection et l'acquisition d'agents pathogènes. Au cours des dix dernières années, des efforts ont été faits pour développer des modèles écologiques réalistes de la croissance des agents pathogènes chez les animaux ou les humains.Ce projet vise àconsidérer, par une approche de modélisation etintégrationde données,les échelles intra-et inter-hôte afin d'étudier l’interactiondes mécanismes à ces deux échelles impliquésdans l'acquisition et la transmission de bactéries pathogènes, notamment résistantes aux antibiotiques.