Formation à l'alignement et à la détection de variants à partir de NGS sous Galaxy

Période: 
Mardi, Mai 9, 2017 - Jeudi, Mai 11, 2017
Centre de recherche: 
Centre de recherche de Toulouse Midi-Pyrénées

La plateformes bioinfo et biostat GenoToul, les équipes Sigenae, NED (GenPhySE), TWB et l'unité MIAT vous proposent 3 cycles d'apprentissage dans les mois qui viennent (2 sous Galaxy et un en ligne de commande) :

 

2,5 jours de formation à l'alignement et à la détection de variants à partir de NGS sous Galaxy du 9 au 11 mai 2017

 

Ce cycle d'apprentissage vous est proposé par l'équipe Sigenae.

 

La première journée sera consacrée à la présentation de l'environnement Galaxy, puis à la prise en main de l'instance toulousaine. Suivront ensuite 1,5 jours de formations vous permettant de comprendre les principaux formats de fichiers manipulés, d'apprendre à aligner les reads sur un génome de référence et de détecter SNP et petits indels via la suite GATK.

 

Aucun pré-requis n'est nécessaire.

 

Ces formations sont organisées sur le site INRA de Toulouse Auzeville.

 

Les tarifs sont disponibles à l'adresse suivante : http://bioinfo.genotoul.fr/index.php/training-2/pricing/.
Les inscriptions s'effectuent sur cette page : http://bioinfo.genotoul.fr/index.php/training-2/training/.