Apprentissage et Analyse d’image : Détection de la viabilité d'embryons

Date limite: 
Vendredi, Décembre 1, 2017
Période: 
02/01/2017 - 02/07/2017
Institut de recherche: 
Ville: 
Jouy en josas
Nom de l'unité/équipe de recherche: 
MaIAGE

Contexte :

INRA/MaIAGE et INRA/BDR sont associées pour créer un logiciel pour l’évaluation précoce de la viabilité d’embryons bovins à partir d’observations en microscopie 2D+Temps. Nous disposons d’ores et déjà d’une centaine de films annotés par un expert du développement. Ainsi plus de 100 mesures qualitatives ou quantitatives peuvent être considérées. Une étude statistique exploratoire de ces données a été conduite et la classification par arbre de régression a permis de sélectionner des mesures discriminantes vis-à-vis de la viabilité. Nous souhaitons maintenant nous focaliser sur quelques unes de ces mesures et les produire de manière automatique.
Les méthodes d’apprentissage ont connu un essor et des succès remarquables ces dernières années. L’adaptation de ces méthodes dans le contexte présent peut être stimulante, en raison du nombre relativement faible d’échantillons (films) observés et annotés. La conception et l’implémentation d’un pipeline pour l’apprentissage et la prédiction seront les aspects centraux de ce stage de master.

Missions :

En tant que stagiaire de master vous aurez à :

  • collaborer avec les statisticiens et biologistes dans la définition du pipeline pour l’évaluation de la viabilité des embryons

  • créer un prototype,

  • documenter le prototype, et

  • rédiger le rapport de stage sur le projet.

Compétences :

  • vous êtes un étudiant motivé poursuivant un master en traitement d’image et apprentissage ou d’autres domaines des mathématiques,

  • vous avez une expérience de programmation et de développement logiciel en C++, Java ou Pytho