Faits marquants

Insyght - navigateur de synténies et d'homologues

Contact : Thomas Lacroix ( )
Unité : MIG (Mathématique, Informatique et Génome) – UR 1077 INRA
Département : MIA/MICA
Centre INRA de Recherche : Jouy-en-Josas

 

Analyse à haute résolution du transcriptome de Bacillus subtilis

Une analyse à haute résolution du transcriptome de Bacillus subtilis par Tiling Arrays explorant une grande variété de conditions de culture (104) a permis de découvrir/confirmer de nombreux nouveaux gènes, promoteurs et terminateurs de transcription, offert un regard inédit sur l’organisation des régulations de l’expression des gènes et posé de nouvelles questions comme la fidélité de la transcription chez la bactérie.
 

Modélisation statistique pour l'analyse de données de ChIP-chip

Nous avons développé des méthodes statistiques pour analyser les données de ChIP-chip, technique permettant d'étudier les interactions protéine-ADN.

RBA : de la gestion parcimonieuse des ressources à l’émergence des réseaux de régulation

L’équipe de Biologie des Systèmes de MIG a mis au point une nouvelle méthode, dénommée RBA (Resources Balanced Analysis), qui étend de façon significative les capacités prédictives de l’ensemble des méthodes dites basées sur des contraintes, et dont la plus emblématique est les FBA (Flux balanced Analysis).