Back to top

Workshop "Recent advances in cell & cell community modeling"

13/11/2017 - 15/11/2017
Type d'événement ou fait marquant: 
Evénement

Le projet labélisé B2SRI, avec le soutien des départements SdV, STIC et Math de l'Université Paris-Saclay, organise un workshop international du lundi 13 novembre 2017 au mercredi 15 novembre 2017 intitulé "Recent advances in cell and cell community modeling", ouvert à toute la communauté scientifique de Paris-Saclay intéressée par ces sujets.

 

Résumé: Ce workshop abordera les défis techniques caractéristiques au développement des modèles cellulaires entières. Les présentations décriront les modèles de cellules entières englobant le métabolisme, la synthèse des protéines et autres sous-systèmes cellulaires, ainsi que plusieurs modèles multicellulaires décrivant des tissus ou des communautés microbiennes. Dans la partie pratique du workshop, nous explorerons les moyens d'automatiser le plus possible la construction de ces modèles, le couplage entre sous-modèles et l'utilisation possible de standard comme le SBML pour le couplage des modèles de cellules hétérogènes. Nous discuterons de l’utilisation du package  SBML « comp » pour le couplage entre modèles dynamiques et stoechiométrique, ainsi que des nouveaux formats de fichiers basés sur du XML et SBML pour décrire les modèles de type allocation de ressources.

 

Le programme prévisionnel du workshop est téléchargeable ici.

 

Clôture des inscriptions: le 10/11/2017.

 

Contact: b2sriworkshop@gmail.com

 

Les organisateurs: Anne Goelzer, Wolfram Liebermeister et Vincent Fromion

Centre Inra ou sera localisé l'annonce: 
Unité organisatrice: